近日，复旦大学附属华山医院神经外科姚瑜教授课题组、病理科熊佶教授和可帮基因研发团队共同在《Acta Neurochirurgica》杂志上发表了题为“Development and validation of a 23-gene expression signature for molecular subtyping of medulloblastoma in a long-term Chinese cohort”的研究成果[1]。研究团队成果开发了基于基因表达谱的髓母细胞瘤分子分型检测（Canhelp®-MB Assay），并在中国髓母细胞瘤人群队列中首次验证其显著临床意义。研究结果证实Canhelp®-MB Assay可准确判断髓母细胞瘤的四种分子亚型，有望成为重要的辅助诊断工具，为改善髓母细胞瘤患者的治疗和预后提供有力支持。
图1. 文章截图
研究背景
髓母细胞瘤（Medulloblastoma, MB）是儿童最常见的中枢神经系统肿瘤，约占16～25％，每100万个人年发病约5例，男女比例约1.8:1[2]。WHO中枢神经系统指南根据基因表达谱的不同将髓母细胞瘤分为WNT型，SHH型，Group 3型和Group 4型四种分子亚型[3]。四种分子亚型的流行病学、临床表现和遗传学特征各不相同，并且在治疗和预后上具有显著差别[4]。其中，WNT型肿瘤由于对放化疗敏感性较高，患者的预后最好，五年生存率约为90%；Group 3型肿瘤恶性程度最高且极易转移，在四种亚型中预后最差，五年生存率仅为50%。
目前髓母细胞瘤的治疗主要以手术切除为主辅助放化疗等综合治疗，但仍有部分患者的治疗效果不佳，预后较差，并且过多的放化疗容易对儿童造成严重的后遗症。因此，明确髓母细胞瘤的分子亚型对于治疗方案选择和减少治疗后遗症至关重要，比如WNT型可通过减少术后放化疗剂量，在有效治疗疾病的基础上降低相关并发症的发生，从而改善患者的生活质量；而Group 3型则需要增加剂量来进一步降低复发风险和改善预后。
目前临床上常规采用免疫组化方法将髓母细胞瘤分为WNT型、SHH型和非WNT/SHH型，但由于主观性差异和低灵敏度，无法对4种分子亚型进行精准识别。尤其是免疫组化方法无法进一步区分Group 3和Group 4两种亚型。
髓母细胞瘤分子分型检测（Canhelp®-MB Assay）
研究团队基于基因表达谱开发了一种髓母细胞瘤分子分型的人工智能模型，并采用实时荧光定量PCR平台建立了多基因检测方法（Canhelp®-MB Assay）。通过检测福尔马林石蜡包埋组织样本中23个分子亚型相关特征基因的表达模式，并与参考数据库中髓母细胞瘤各分子亚型的基因表达模式进行比较，客观判断髓母细胞瘤的四种分子亚型（图2）。Canhelp®-MB Assay已获得中、美两国发明专利授权；相关研究结果发表于美国临床肿瘤学术年会（ASCO）和欧洲肿瘤内科学术年会（ESMO）等高水平国际学术会议。
图2. Canhelp®-MB Assay检测流程
研究收集了复旦大学附属华山医院共142例髓母细胞瘤患者的福尔马林石蜡包埋组织样本，采用Canhelp®-MB Assay进行基因表达谱检测并判断分子亚型。检测结果为WNT型（21例，15%），SHH型（41例，29%），Group 3型（16例，11%）和Group 4型（64例，45%）。同时，研究人员收集28例临床样本，采用Canhelp®-MB Assay与美国同类产品NanoString nCounter Assay进行头对头比较，两种检测方法的一致性达到96.4%（27/28）。
进一步地，研究人员基于长期随访数据（中位随访时间为34.1个月），深入分析患者的预后特征发现四种分子亚型的总生存期和无进展生存期存在显著差异（p < 0.0001）。其中，四种分子亚型的5年总生存期分别为80%（WNT型），62%（SHH型），27%（Group 3型）和47%（Group 4型）（图3a），5年无进展生存期分别为80%（WNT型），52%（SHH型），27%（Group 3型）和45%（Group 4型）（图3b）。不同分子亚型的临床预后特征与国内外相关研究报道高度一致。
图3. 四种分子亚型的生存曲线图（a）总生存期（b）无进展生存期
Canhelp®-MB Assay作为国内首款髓母细胞瘤基因表达谱检测产品，已成功应用于临床。通过中国患者的大样本量临床验证，证实Canhelp®-MB Assay在髓母细胞瘤分子分型中具有优异的分析性能。该检测方法有助于临床医生对髓母细胞瘤患者进行精准的预后评估，并为制定个性化的治疗方案提供重要支持，从而改善患者的预后。此外，Canhelp®-MB Assay采用了常规的实时荧光定量PCR平台，并且兼容病理科常用的福尔马林石蜡包埋组织，展现出了其在临床应用中的可靠性和可及性，有望成为临床上的重要辅助诊断工具。
